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Los criterios que utilizamos para la clasificación son los siguientes:
El concepto de especie es más que nada un concepto intuitivo, por ejemplo, un grupo de científicos estaba estudiando aves de Nueva Guinea y concluyeron que había 136 especies mientras que los indígenas poseían también 136 nombres distintos para cada especie. Científicamente, especie se define como el taxón con entidad fundamental en la clasificación.
A lo largo de la historia han habido varios conceptos diferentes de especie. Linneo definía una especie tipo, fija y creada por Dios, y las distinguía según la morfología. Darwin con la teoría de la evolución llegó a la conclusión de que unas especies provienen de otras, es la especie biológica, formada por organismos pero en ningún caso fija. Por último el concepto de especie genético, utilizado para especies que se reproducen sexualmente. Define la especie como un conjunto de (población o poblaciones) de organismos capaces de reproducirse entre sí, al menos potencialmente, pero no con miembros de otros grupos (otras especies). En este caso surge un problema y es que entre los vegetales no existen la fertilidad o esterilidad absolutas entre dos grupos de organismos.
La formación de especies se produce gracias a un intercambio genético entre poblaciones distintas o sea entre especies distintas. Este intercambio no se realiza porque existen unos mecanismos de aislamiento que limitan en base a la diversidad fisiológica.
Estos mecanismos son:
Existen tres modelos para la formación de las especies: la teoría geográfica, la clásica y la cuántica.
La teoría geográfica consiste en aprovechar el hábitat para formar nuevas especies, para esta teoría el lugar ideal son las islas pues son espacios pequeños y se reproducirían entre sí.
La teoría clásica consiste en que partiendo de una población homogénea en un ambiente homogéneo, se produce una separación de poblaciones, por ejemplo, por migración y se produce una diversificación del ambiente. Con el paso del tiempo los mecanismos de aislamiento van aumentando y llegarían a un extremo al que no se podrían juntar debido a las grandes diferencias.
La teoría cuántica consiste en que partiendo de una población homogénea en un ambiente homogéneo se produce un cambio muy brusco, como por ejemplo un volcán que forma una isla en el mar a la que llega un coco flotando y la coloniza. Después de esta colonización ocurre una CATÁSTROFE y se pierde casi toda la población. Después la población se recupera y se pasa a un aislamiento genético.
Estos procesos son más lentos cuanto mayor es el número de especies. El método clásico es por selección natural mientras que el cuántico son factores aleatorios.
La especiación es más sencilla en plantas que en animales debido principalmente a:
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