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El cuerpo es helicoidal y flexible, entrelazado con el filamento axial (por encima de la capa de mureína). Dentro de esta estructura está el cilindro protoplásmico (cuerpo de la bacteria) y la membrana externa.
El filamento axial tiene la estructura de un flagelo, y también se llama endoflagelo. Se encuentran fijados en los extremos de las espiroquetas, existiendo endoflagelos en ambos lados de la bacteria. La longitud de los endoflagelos es 2/3 de la longitud de la bacteria. Pueden existir desde dos a cientos. Debido a su tamaño, existe una zona donde se superponen los endoflagelos.
Los endoflagelos tienen mucho que ver con la movilidad que es muy peculiar, puede ser por: flexión, latigazo y por guía geométrica.
Se mueven mucho mejor a viscosidades elevadas: tactismo positivo para viscosidades elevadas, por lo que se mueven mejor en lugares como lodos o mucosas animales.
Los flagelos se mueven por rotación, como una hélice, por lo que gira la envuelta de la bacteria y si hay rozamiento (por la elevada viscosidad) se frena la envuelta y la bacteria avanza.
Es por fisión binaria. En la zona donde se van a dividir se generan nuevos flagelos, y a continuación, se origina un septo y se separan las bacterias. En cultivo puro hay pocas espiroquetas.
Son un "cluster", formando una agrupación filogenética. Son resistentes a la rifampicina (antibiótico) que inhibe la ARN polimerasa. En este caso tienen una ARN polimerasa especial que evolucionó conjuntamente.
Hay bacterias parásitas, patógenas y de vida libre.
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